宁夏回族自治区博物馆的前身是1959年9月成立的宁夏地质博物馆筹备。

  1973年,宁夏地质博物馆筹备处正式更名为宁夏回族自治区博物馆,馆址位于自治区首府银川市承天寺院内,占地面积2.24万平方米,建筑面积7000多平方米。

  1988年,宁夏博物馆所在的承天寺院整饬重修为仿古建筑。

  1997年,宁夏博物馆被中共央宣传部定为全国首批百家爱国主义教育示范基地之一。

  2004年,宁夏回族自治区政府决定将宁夏博物馆新馆建设列为自治区成立50周年大庆的献礼工程。

  2006年,总投资2.28亿的宁夏回族自治区博物馆新馆破土动工,总建筑面积3.0258万平方米。

  2008年8月,宁夏博物馆新馆建成并投入使用。

  2012年12月7日,宁夏博物馆获批成为“国家一级博物馆”。

  2014年5月,宁夏博物馆被自治区党委命名为第一批党史宣传教育基地。

  2018年9月,习近平总书记为宁夏回族自治区成立60周年题词“建设美丽新宁夏 共圆伟大中国梦”的贺匾悬挂在宁夏博物馆大厅。